Az MIT-n (Massachusetts Institute of Technology) fejlesztették ki az első, széles körben használt verziót 1986-ban - az X10R4-et.
1987-ben készült el az X11-es verzió.
1988. januárjában megalakult az X Consortium, amelynek célja az X Window System továbbfejlesztése és szabványosítása.
1993-ban az X Consortium átalakult egy független, non-profit intézménnyé, és az MIT átruházta rá az összes jogot az X Window System-mel kapcsolatban. A Consortium tagjai (többek között):